萨迦派采用款氏家族世代相传的传承方法。1้世纪中，萨迦派展成具有强大政治势力的教派，有过著名的“萨迦五祖”。代表人物有萨迦五祖。初祖贡噶宁波1้10่？一118、二祖索南孜摩11一1้、三祖扎巴坚赞1้1一1้1้、四祖萨迦班智达贡噶坚赞1一11、五祖八思巴追坚赞1้一180，萨迦班智达侄子。1้年，萨迦班智达应蒙古皇子阔端邀请赴凉州会谈，为元朝统一西藏作出了重要贡献。后来，八思巴被元世祖忽必烈封为国师、帝师，领总制院事，管理西藏地方แ政教事务。1้年西藏建立萨迦派政教合一地方แ政权，在元中央王朝的支持下，萨迦派势力大增，其寺院及势力波及到เ康区和安多各地，对元朝皇室亦有重大影响。与此同时，萨迦派内部的矛盾亦逐渐展，1้萨迦寺分成细脱、仁钦๔岗、拉康、都却个拉章，各领属民、土地。1้1年，萨迦派在西藏的掌权地位被帕竹噶举派的大司徒绛曲坚赞取代，萨迦势力日渐衰落。明成祖时，封萨迦领为大乘法王，萨迦派仅保有萨迦附近一小片领地，其领称萨迦法王。明朝中期，其他个拉章传承断绝，都却拉章则再分为ฦ彭措颇章和卓玛颇章两ä房，延续至今，萨迦法王由两房的长子轮流担任。现今的萨迦法王在美国居住。
后金大军到达呼和浩特后，林丹汗在成吉思汗陵前举行庄严的仪式，宣称自己้为ฦ全蒙古的“林丹巴图鲁汗”，遂带领ๆ察哈尔、鄂尔多斯部ຖ众，移动成吉思汗之陵，西渡黄河至大草滩。林丹汗在大草滩永固城一带拥众落帐，等待时机，重整旗鼓，准备东山再起。此时，一向坚决支持林丹ล汗事业的漠北喀尔喀却图台吉土谢图汗部，于1年初，率所部万之众，直奔大草滩与林丹汗会合。林丹汗和却图台吉通过红教的关系，与藏巴๒汗和白利康区土司顿ู月多吉建立了联系金巴道尔吉《水晶鉴》，留金锁校注。
塔什干：锡尔河上游的历史名城，可能是突厥人建立的第一个永久定居点。早在前二世纪就建有城池，六世纪就以商业、手工业著称，成为ฦ古代丝绸之路的必经之地。塔什干地处中亚心脏地带，骄阳之下，沙浪ฐ滚滚，故素有“荒原”之称。因此，水在这里显得尤为珍贵。相传一位美貌的公主ว许诺愿嫁给能引水灌溉荒原的勇士，以解当地居民缺水之ใ难。于是，一位名叫法尔哈德的勇士便设法把一块巨石投入河中，来提高水位，引锡尔河水灌溉荒原。后来这位勇士得知公主ว因受骗含恨自尽，也殉自杀。塔什干在乌兹别ี克语中意为“石头城”，因地处山麓冲积扇一带，有巨เ大卵石而得名。11世纪见史书记载。年成为一座建有城墙的城市，当时的人口约万，是与俄国进行贸易的主ว要中心，后来并入俄罗斯帝国。年成为土耳其斯坦总督区的行政中心。190่年起成为乌兹别克共和国府，1้1年8月1日起成为独立的乌兹别克斯坦共和国的都。塔什干有新、旧城之分，清真寺、陵墓等古迹大都集中在旧城。19年月日清晨的一次强烈地震几乎将全城变为废墟，使0万人无家可归。震后城市进行了大规模重建。
内喀尔喀部分台吉与后金通婚、盟誓等事，引起了林丹汗的疑心。他严厉指责管理左翼三万户的大臣锡尔呼纳克杜棱洪台吉管束不得力，甚至怀疑他暗中与努尔哈赤已有联系，准备对锡尔呼纳克杜棱洪台吉和其他诸台吉采取必要的措施。这反而加了蒙古内部的分化。本来从林丹汗信奉红教后，尊崇宗喀巴黄教多年的漠北喀尔喀以及漠南影响较大的诸部ຖ，已与林丹ล汗貌合神离，开始自行其是了。1年二月，管理左ุ翼三万户的特命大臣锡尔呼纳克杜棱洪台吉与林丹汗生分歧，遂率领所属乌齐叶特部与明安谔勒哲依图台吉所属乌噜特部共三千多户，投奔辽阳城，归顺了努尔哈赤。受其影响，1年正月，内喀尔喀拉巴๒什希布、索诺木、莽果、台吉等也各率所属五百户投奔了辽阳城。此时，乌珠穆沁部ຖ翁衮都喇尔子多尔济车臣济农与其叔之子塞棱额尔德尼台吉也因与林丹汗不和，率部投奔了漠北喀尔喀车臣汗硕垒。苏尼特部素塞巴图噜济农、浩é齐特部策凌伊尔登、阿巴噶部都思噶尔札萨克图济农各率所部，也投奔了漠北喀尔喀车臣汗硕垒。
这一派支系众多，有达波噶举和香巴噶举两ä大传承。达波噶举系统的创始人是达波拉结，但渊源却可以追溯到玛尔巴、米拉日巴师徒。达波拉结是米拉日巴的上弟子之一，111年在达布建冈布寺，收徒传法。他融汇噶当派的《道次第》和米拉的《大手印》教授，写成《道次第解脱庄严论》，逐渐形成独特的风规，而成“达布噶举派”。后来，达波拉结的众多门徒展出更多的支系，通常有“四系八支”之称，遍布于藏区等地，至今未衰。达波噶举中ณ的帕竹噶举、噶玛噶举ะ的上层曾受元、明两ä朝册封，相继执掌西藏地方政权。格鲁派兴起后，噶举派中仅有止贡、噶玛、达隆、主巴四支系保有一定势力。香巴噶举系统的创น始人是琼波南交巴，故也称琼布噶举。因琼波南交巴在后藏的香地区shangs广建寺庙，传法讲道，故称“香巴噶举派”。
噶举派主要寺院有西藏墨竹工卡的止贡寺、四川德格的八邦ะ寺等。
噶举派主要学说是月称派中观见，重密宗，采取口耳相传的传授方แ法，曾融合噶当派教义แ。修习上，噶举派注重修身，主修大手印法。大手印有显密之分。显教大手印为修心法门，修的是空性大手印，它要求修行者心住一境，不分别善恶美丑，以得禅定。密教大手印为修身法门，密宗大手印则ท以空乐双运为道，分实住太平印、空乐大平印和光明大手印等。大平印修身的方法有四种，最主要的目的是通过对人体呼吸、脉ำ、明点心的修炼，而达到一种最高境界。
噶当派：噶当派创建于10年。藏语“噶”指佛语，“当”指教授。通俗说法是用佛的教诲来指导凡人接受佛教道理。噶当派的奠基人，是古格时期从印度迎请过来的著名佛教大师阿底峡，热振寺是噶当派的主寺。该教派以修习显宗为主，主ว张先显后密。
在噶当派传承中，形成了三个主ว要支派：教授派、教典派、教诫派，并各有自己所依的典籍和教义。1世纪晚期，一位名叫泅丹ล惹迟的噶当教典派僧人，把噶当派的纳塘寺搜集保存的大量藏译佛经编订成《甘珠尔》、《丹珠尔》。这就是在佛教历史上具有重要地位的藏文《大藏经》最早ຉ的编纂本。噶当派由于教理系统化、修持规范化，因而对藏传佛教其他各派都有重大影响。噶举、萨迦派的一些重要僧人都向噶当派学习。而格鲁派则ท是直接在噶当派的基础上建立的，故有“新噶当派”之称。此外，藏传佛教中一切大论的讲说，也都源于噶当派。1世纪时格鲁派兴起后，因格鲁派是在噶当派教义的基础上展而来的，因此原属噶当派的寺院，都逐渐成了格鲁派的寺院，噶当派从此在藏区隐灭。