1年三月，皇太极决定第三次远征察哈尔林丹ล汗，传令归顺后金的蒙古各部率部来会。四月，科尔沁、札鲁特、巴๒林、奈曼、敖汉、喀喇沁、土默特、阿鲁科尔沁、翁牛特、阿苏特等部的部长台吉会于西拉木伦河岸，总兵力约1้0万。四月下旬，皇太极率领大军越过兴安岭，驻守都埒河。当夜，镶黄旗两个ฐ蒙古人偷马逃出，将大军压境的消เ息报告给林丹ล汗。林丹汗欲率部ຖ撤至漠北喀尔喀，但喀尔喀三汗与他不和。于是林丹汗率领所属10万之众，西奔库赫德尔苏，经呼和浩é特，渡黄河到เ达鄂尔多斯。皇太极分兵三路穷追林丹汗1天，五月下旬进驻呼和浩é特，得知林丹ล汗已南渡黄河而去。遂停止追击，经宣府、张家口返回。途中收拢了林丹汗所遗部ຖ众数万人。
林丹汗病故后，皇太极于1年二月命多尔衮、岳托、萨哈廉、豪格领兵1万，前往鄂尔多斯寻找林丹汗子额哲。三月，多尔衮在西喇珠尔格地方遇到เ林丹汗的妻子囊囊，得知额哲所在地。四月二十日，渡过黄河，至托里图找到了额尔克孔果尔额哲。后来，后金统治者将察哈尔部安置于义州，分设左右翼察哈尔八旗，封林丹汗子额哲为ฦ亲王，并将皇女马喀塔格格嫁之ใ，设都统和副都统统治察哈尔左右翼。
11้9๗年七月的铁岭战役后，努尔哈赤频繁遣人至内喀尔喀，要求诸台吉与后金盟誓修好，共同对付明朝。努尔哈赤与内喀尔喀建立同盟的目的是为ฦ了离间内喀尔喀与林丹ล汗的关系。十一月，在内兴安岭的色特尔黑地方，内喀尔喀五部部分台吉与努尔哈赤所遣使臣额克星额、绰库尔、雅希禅、库尔禅等刑白马乌ไ牛，设酒盟誓，表示ิ彼此修好，与明朝为ฦ敌《皇清开国方略》卷。1้1年十一月，内喀尔喀五部的古尔布什、奔古勒二台吉率领所属六百户，至辽阳归附于后金《皇清开国方略》卷。努尔哈赤设大宴迎接，并将松古图公主嫁给了古尔布什台吉。
林丹汗为了有效地控制蒙古各部和巩固汗权，以察哈尔部为基础，直接控制了内喀尔喀巴๒林、札鲁特、巴岳特、乌齐叶特、弘吉剌特等五部，同时也遥控了蒙古其他各部。林丹汗执政前期，漠北喀尔喀三汗以及漠南喀喇沁的昆都伦汗、阿鲁科尔沁的车根汗、科尔沁奥巴洪台吉、鄂尔多斯土巴济农等，定期前往察汉浩é特，朝见林丹汗，并与大汗共同商讨政务大事，参加大汗举行的宴会、围猎等活动。蒙古各部汗、济农、诺延、台吉，按照图们札萨克图汗约束诸鄂托克，并定期向林丹汗朝贡献物《大黄册》，19年列宁格勒版。
新疆哈萨克部：新า疆北部和东部ຖ一带曾经是与古代游牧部族休养生息的地方。据中ณ国史书记载，天山、阿尔泰山、塔尔巴哈台山脉、准噶尔盆地以及伊犁盆地都有着与哈萨克民族的渊源有着密切关系的突厥、葛逻禄、突骑施、克普恰克、基马克、阿尔根、乃蛮、克烈、蔑儿乞惕、札剌亦儿、弘吉剌惕、瓦克等部族的故地。
从10年，清朝平定了准噶尔暴乱之后，哈萨克人就开始考虑迁回自己故地的问题。特别是乃蛮、乌ไ孙、克烈、瓦克等部族已๐开始返回伊犁、塔尔巴哈台、阿勒泰、博尔塔拉等地。据《高宗皇帝宫廷志》一书，1年月1日，清朝照会伊犁将军：“伊犁等处土地辽阔，人烟愈多愈善。哈萨克族人不得游牧地方，或畏惧劫掠，愿内附者，即行收留แ。……”。1年8月间，清王朝通知哈萨克阿布赉汗，哈萨克族牧人可以到伊犁等地居住放牧。因而当时就有臣属于阿布赉汗的哈萨克人迁徙到เ塔尔巴哈台地区。大玉兹乌孙哈萨克人也在世纪0年代起迁归伊犁地区。在当时，根据清王朝体制，除了现在的阿勒泰地区吉木乃县之外，所有的县府都归乌拉斯台平定边塞左大将霍布达参谋丞相管辖。因此，十二个阿巴克克烈部落所属的千户人家于10年乾隆年间先搬迁到了吉木乃霍布克沙热一带，后来陆陆续续分散到属于阿勒泰地区的其他县和塔尔巴哈台一带定居，一部ຖ分乃ี蛮部ຖ落也随他们一道来到这儿。乃蛮部落的大部分先是迁徙到塔尔巴๒哈台一带居住，其中ณ的克宰依部虽然起初ม在托合达——巴尔勒克山一带，后来又在塔尔巴哈台居住了很长一段时期。但当后来乃ี蛮部ຖ落的其他各部陆续来到这里，部ຖ分阿巴克克烈部落也定居在属塔尔巴๒哈台的托里县境内时，克宰依部又开始迁徙。一部分人经博尔塔拉，另一部分人经尼勒克、新源，最终都在伊犁地区所属地界定居。这次迁徙始于19๗世纪六七十年代，历经十几年才告结束。